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[意见建议] 测替代外显子的剪接复杂

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发表于 2023-8-5 11:52:49 | 显示全部楼层 |阅读模式


进一步研究,例如,(i)高剪接复杂性的外显子是否普遍存在于哺乳动物中?(ii) 哪些类型的基因往往包含高剪接复杂性的事件?(iii) 可以通过外显子的特征来预测外显子的剪接复杂性吗?(Ψ) 替代外显子的剪接复杂性在组织之间和发育过程中是否会发生变化?(v) 如果是这样,剪接复杂性变化的进化和功能意义是什么?为了回答这些问题,我们从


七个物种的六个组织中获取了 RNA-seq 数据,并量化了 AS 事件的Telegram 用户号码列表剪接复杂性(图 S 2 ))。我们的结果表明,高复杂性事件(即剪接熵≥1.0;样本中存在两个或多个剪接结果)在哺乳动物中普遍存在。我们还发现,外显子的剪接复杂性往往与宿主基因的特征有关,利用外显子属性训练的机器学习和深度学习模型可以适度预性。此外,

我们发现一些替代外显子往往在组织之间或发育过程中发生剪接熵变化。总体而言,我们系统地表征了哺乳动物中替代外显子的剪接复杂性,这表明剪接复杂性是除了常用的剪接包含水平之外,替代外显子的另一个重要属性。 结果 高复杂性 AS 事件在哺乳动物物种中普遍存在 为了调查具有高剪接复杂性的事件的普遍性,利用来自六种哺乳动物(人类、
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